Hé bien à vrai dire je ne suis pas arrivé à résoudre le problème en modifiant les variables PATH et CLASSPATH. J'ai donc ajouté la librairie JMF à la main dans le .jar de Wapcamserver. Un peu tordu ma ...
J'ai une Logitech Quickcam en USB sur un PC avec Mandriva 2006, tout est bien configuré au niveau des pilotes (Video4Linux, etc). Idem pour Java et JMF.